Comision bancaria en punto de venta

Quiero reportar el siguiente problema yo tengo configurado en el sistema modo mostrador es decir los mostradores generan la venta se pasa a caja pero cuando se cobra en caja al cliente le cargamos una comisión por pago de tarjeta pero al finalizar el día la comisión no aparece en el corte pero si lo coloco modo autoservicio si aparece en el corte, por lo que me gustaría ver la solución de ese error