negativos en las pólizas de cheque

Buen día, lo que pasa es que al generar una póliza de cheque marca las aplicaciones de pago en negativos, hasta en los estados de cuenta, son contadas las veces que pasa, ya que no es siempre, en este caso se cancelo y se volvió a hacer otra póliza de cheque y ya no marco los negativos, pero mi duda es, porque aveces marca los negativos las aplicaciones de pago o a que se debe este error?, Gracias por su atención